L’aubier se trouve dans la partie intérieure de l’écorce. Il s’agit de la zone vivante de l’arbre située entre le bois dur au centre du tronc et l’écorce. L’aubier est détaché de l’écorce et séché. Seuls les troncs et les grosses branches sont utilisés. En effet il renferme des acides aminés du fraxoside des acides-phénols de l’esculoside et des tanins. Cette partie est la plus riche en principes actifs. Il y circule la sève. L’aubier est par conséquent récolté lors de la montée de la sève afin de préserver un maximum de ces principes actifs. Traditionnellement utilisé pour faciliter les fonctions d’élimination de l’organisme. L’aubier de tilleul facilite notamment l’élimination rénale.